O Inest tem sua origem no Núcleo de Estudos Avançados da UFF, criado em 21 de agosto de 1986, durante a gestão do Reitor da UFF José Raymundo Martins Romeo. Iniciou suas atividades sob a coordenação executiva do professor René Armand Dreifuss e coordenação adjunta do Professor Eurico de Lima Figueiredo, mas passou por inúmeras dificuldades durante os anos 1990, até interromper suas atividades. Um novo Conselho Acadêmico composto pelo Professor Eurico de Lima Figueiredo, como Coordenador Executivo, pelo Almirante de Esquadra Mauro César Rodrigues Pereira e pelo Prof. Otávio Velho, Titular e Emérito da Universidade Federal do Rio de Janeiro, respectivamente como Presidente, e como Vice-Presidente, tomou posse em cerimônia solene realizada em novembro de 2004. Naquele momento, foi criada a área de concentração em Estudos Estratégicos, anexada a estrutura curricular do mestrado do novo programa de Pós- graduação em Ciência Política, então coordenado pelo Professor Eurico de Lima Figueiredo. O Doutorado foi aprovado pela CAPES logo em 2005, mantendo a mesma área de concentração, assim como o Projeto Rede Brasil de Defesa, apresentado pelo NEST-UFF/ PPGCP. A criação do curso de graduação em Relações Internacionais com habilitação em Estudos Estratégicos e Comércio Exterior foi proposta em 2006 e aprovada pelo CUV-UFFdois anos depois. As atividades do curso iniciaram-se em 2009, registrando o índice de segundo curso mais procurado na UFF, naquele ano. Pouco depois, o CUV aprovou à criação do Instituto de Estudos Estratégicos (INEST), que atualmente funciona no Campus do Valonguinho.